Sebastian Hupfauf, PhD

Postdoc

Institut für Mikrobiologie
Technikerstr. 25d
A-6020 Innsbruck

Bauteil V, 1. Stock, Raum 0/519

Tel.: +43 512 507-51326
Mail: Sebastian.hupfauf@uibk.ac.at

Sebastian Hupfauf

Forschungsgebiete

  • Bioinformatik
  • Anaerobe Vergärung
  • Biogas Produktion
  • Molekulare Ökologie
  • Abwasserepidemiologie
  • Next-Generation Sequencing

Projekte

Publikationen

Publikationen 2024

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
  • Suraporn, S.; Cansee, S.; Hupfauf, S.; Klammsteiner, T. (2024): Lactic Acid Bacteria from Bombyx mori Frass: Probiotic Properties and Antagonistic Activities.
    In: Agriculture-Basel 14/6, No. 924. (DOI) (Weblink)

  • Winkler, Jacqueline; Neuner, Thomas; Hupfauf, Sebastian; Arthofer, Anna; Ebner, Christian; Rauch, Wolfgang; Bockreis, Anke (2024): Impact of impeller design on anaerobic digestion: Assessment of mixing dynamics, methane yield, microbial communities and digestate dewaterability.
    In: Bioresource Technology 406, Nr. 131095. (DOI) (Weblink)

Beitrag in einem Ausstellungs-/Museumskatalog
  • Hupfauf, S.; Wagner, A.; Walter, A.; Wehner, M. (2024): Biogas: Mikroben als grüne Energieproduzenten.
    In: Insam, Heribert; Ascher-Jenull, Judith: Science Center MikroMondo – Ein Gruß aus der Küche. Innsbruck: Alpina Druck., ISBN 978-3-900122-28-7, S. 126 - 127. (Weblink)

Sonstige Publikationen

elektronische Publikation, wissenschaftliche
  • Hupfauf, Sebastian (2024): DNA Sequencing For Newbies And Pros. Autor: Mirage News. (Weblink)



Vorträge 2024

Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.

Konferenzvortrag (Invited Plenary / Keynote Lecture)
  • Vortragende/r: Insam, Heribert Co-AutorInnen: Podmirseg, Sabine Marie; Klammsteiner, Thomas; Hupfauf, Sebastian: Microbes and Climate with a special emphasis on waste management.
    11th International Conference on Sustainable Solid Waste Management, Rhodos, 20.06.2024. (Weblink)

Konferenzvortrag (auf Einreichung / Anmeldung)
  • Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Kleidorfer, Irene; Whittle, Ingrid; Bischof, Daniela; Bockreis, Anke; Insam, Heribert; Müller, Wolfgang; Wehner, Marco: Decentralised system for demand-oriented collection of food waste - assessment of biomethane potential, pathogen development and microbial community structure.
    11th International Conference on Sustainable Solid Waste Management, Rhodos, 20.06.2024. (Weblink)



Publikationen 2023

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
  • Steiniger, Bettina; Hupfauf, Sebastian; Insam, Heribert; Schaum, Christian (2023): Exploring Anaerobic Digestion from Mesophilic to Thermophilic Temperatures—Operational and Microbial Aspects.
    In: Fermentation-Basel 9/9, Nr. 798. (DOI) (Weblink)

  • Wehner, Marco; Kleidorfer, Irene; Whittle, Ingrid; Bischof, Daniela; Bockreis, Anke; Insam, Heribert; Müller, Wolfgang; Hupfauf, Sebastian (2023): Decentralised system for demand-oriented collection of food waste – Assessment of biomethane potential, pathogen development and microbial community structure.
    In: Bioresource Technology 376, Nr. 128894. (DOI) (Weblink)



Vorträge 2023

Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.

Konferenzvortrag (auf persönliche Einladung)
  • Vortragende/r: Insam, H Co-AutorInnen: Markt, R; Wagner, AOW; Nägele, F; Hupfauf, S; Klammsteiner, T; Payr, M; Rauch, W: SARS-CoV-2-Abwassermonitoring und Zukunftsperspektiven.
    11. Reichersberger Umwelttag, Reichersberg, 02.03.2023. (Weblink)

Konferenzvortrag (auf Einreichung / Anmeldung)
  • Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Wehner, Marco; Whittle, Ingrid; Müller, Wolfgang; Kleidorfer, Irene; Insam, Heribert; Bockreis, Anke: Assessment of decentralized food waste storage in a tank system.
    ISAM 2023 - 12th International Symposium on Anaerobic Microbiology, Innsbruck, 24.05.2023. (Weblink)

  • Vortragende/r: Klammsteiner, Thomas Co-AutorInnen: Insam, Heribert; Suraporn, Siripuk; Hupfauf, Sebastian: Frass-tastic additive: Exploring the value of insect frass in anaerobic digestion.
    ISAM 2023 - 12th International Symposium on Anaerobic Microbiology, Innsbruck, 24.05.2023. (Weblink)

Beitrag als Chairperson / SektionsleiterIn / DiskussionsleiterIn / DiskussionsteilnehmerIn
  • Hupfauf, Sebastian: Chair of Session 7: Syntrophic models and specific microbial groups.
    ISAM 2023 - 12th International Symposium on Anaerobic Microbiology, Innsbruck, 25.05.2023. (Weblink)

Vortrag bei Expertentagung
  • Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Wehner, Marco; Whittle, Ingrid; Müller, Wolfgang; Kleidorfer, Irene; Insam, Heribert; Bockreis, Anke: Dezentrales System zur bedarfsgerechten Sammlung von Speiseabfällen.
    Biogas Kongress 2023, Linz, 30.11.2023. (Weblink)

Posterpräsentation
  • Vortragende/r: Habel, Magdalena; Wehner, Marco Co-AutorInnen: Hupfauf, Sebastian; Plachot, Julie; Ebner, Christian; Bockreis, Anke; Insam, Heribert: Steigerung der Biogasproduktion durch Umstellung von einem parallelen Betrieb in einen seriellen Betrieb.
    Österreichische Abfallwirtschaftstagung: Resilienz der/durch Abfallwirtschaft, Alpbach, 19.04.2023. (Weblink)

  • Vortragende/r: Pansoni, Caterina; Habel, Magdalena Co-AutorInnen: Plachot, Julie; Ebner, Christian; Insam, Heribert; Bockreis, Anke; Wehner, Marco; Hupfauf, Sebastian: Strategien zur Optimierung der anaeroben Vergärung von Klärschlamm.
    Österreichische Abfallwirtschaftstagung: Resilienz der/durch Abfallwirtschaft, Alpbach, 19.04.2023. (Weblink)

Gastvorträge

Gastvortrag
  • Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Klammsteiner, Thomas; Plattner, Pia; Winkler, Anna; Insam, Heribert; Podmirseg, Sabine M.: Anaerobic digestion - Aspects of renewable energy and circular economy.
    Khon Kaen University, Kohn Kaen, 25.01.2023. (Weblink)

  • Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Klammsteiner, Thomas; Plattner, Pia; Winkler, Anna; Insam, Heribert; Podmirseg, Sabine M.: Anaerobic digestion - Aspects of renewable energy and circular economy.
    Mahasarakham University, Maha Sarakham, 23.01.2023. (Weblink)

  • Vortragende/r: Klammsteiner, Thomas Co-AutorInnen: Hupfauf, Sebastian; Heussler, Carina D.; Insam, Heribert; Schlick-Steiner, Birgit C.; Steiner, Florian M: Understanding biotic and abiotic dynamics of black solider fly farming.
    Mahasarakham University, Maha Sarakham, 17.01.2023. (Weblink)

  • Vortragende/r: Klammsteiner, Thomas Co-AutorInnen: Hupfauf, Sebastian; Heussler, Carina D.; Insam, Heribert; Schlick-Steiner, Birgit C.; Steiner, Florian M.: Industrial insect farming for waste management and insect microbiome research.
    Khon Kaen University, Kohn Kaen, 25.01.2023. (Weblink)

  • Vortragende/r: Klammsteiner, Thomas Co-AutorInnen: Hupfauf, Sebastian; Insam, Heribert: F4G: Frass for gas – an ASEA-UNINET project.
    Mahasarakham University, Maha Sarakham, 24.01.2023.



Publikationen 2022

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
  • Amman, F.; Markt, R.; Endler, L; Hupfauf, S.; Agerer, B.; Schedl, A.; Richter, L.; Zechmeister, M.; Bicher, M.; Heiler, G.; Triska, P.; Thornton, M.; Penz, T.; Senekowitsch, M.; Laine, J.; Keszei, Z.; Klimek, P.; Nägele, F.; Mayr, M.; Daleiden, B.; Steinlechner, M.; Niederstätter, H.; Heidinger, P.; Rauch, W.; Scheffknecht, C.; Vogl, G.; Weichlinger, G.; Wagner, AO.; Slipko, K.; Masseron, A.; Radu, E.; Allerberger, F.; Popper, N.; Bock, C.; Schmid, D.; Oberacher, H.; Kreuzinger, N.; Insam, H.; Bergthaler, A. (2022): Viral variant-resolved wastewater surveillance of SARS-CoV-2 at national scale.
    In: Nature Biotechnology 40, S. 1814 - 1822. (DOI) (Weblink)

  • do Carmo Precci Lopes, Alice; Ebner, Christian; Gerke, Frédéric; Wehner, Marco; Robra, Sabine; Hupfauf, Sebastian; Bockreis, Anke (2022): Residual municipal solid waste as co-substrate at wastewater treatment plants: An assessment of methane yield, dewatering potential and microbial diversity.
    In: Science of the Total Environment 804, Nr. 149936. (Volltext) (DOI) (Weblink)

  • Masebinu, SO; Fanoro, OT; Insam, H; Mbohwa, C; Wagner, AO; Markt, R; Hupfauf, S (2022): Can the addition of biochar improve the performance of biogas digesters operated at 45°C?
    In: Environmental Engineering Research 27/2, No. 200648. (DOI) (Weblink)

  • Walter, Andreas; Hanser, Maria; Ebner, Christian; Insam, Heribert; Markt, Rudolf; Hupfauf, Sebastian; Probst, Maraike (2022): Stability of the Anaerobic Digestion Process during Switch from Parallel to Serial Operation—A Microbiome Study.
    In: Sustainability 14/12, No. 7161. (DOI) (Weblink)

Medienbeiträge

Beitrag in Zeitung
  • Hupfauf, S; Etemadi, M; Insam, H; Podmirseg, S.M: DNA-Sequenzierung für Einsteiger und Profis.
    In: Newsroom - www.uibk.ac.at vom 11.02.2022. (Weblink)



Vorträge 2022

Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.

Posterpräsentation
  • Vortragende/r: Hupfauf, S Co-AutorInnen: Amman, F; Insam, H; Wagner, A.O; Markt, R: DeViVa – Deconvolution of Virus Variants.
    Abschlussmeeting Projekt Schulstandortmonitoring, Wien, 30.05.2022.

  • Vortragende/r: Hupfauf, S Co-AutorInnen: Etemadi, M; Insam, H; Podmirseg, S.M: CoMA 3.0 – The intuitive and user-friendly pipeline for amplicon sequencing data analysis.
    International Conference on Biogas Microbiology (ICBM-4), Braga, 09.05.2022. (Weblink)

Einzelvorträge (berufliche Weiterbildung / Wissenstransfer)

Vortrag (Wissenstransfer / Weiterbildung)
  • Vortragende/r: Hupfauf, S Co-AutorInnen: Ebner, C; Insam, H: Biomethanisierung von Wasserstoff.
    FFG Innovationscamp S - Wasserstofftechnologie, Innsbruck, 21.10.2022. (Weblink)



Publikationen 2021

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
  • Tukanghan, Wisarut; Hupfauf, Sebastian; Gómez-Brandón, María; Insam, Heribert; Salvenmoser, Willi; Prasertsan, Poonsuk; Cheirsilp, Benjamas; O-Thong, Sompong (2021): Symbiotic Bacteroides and Clostridium-rich methanogenic consortium enhanced biogas production of high-solid anaerobic digestion systems.
    In: Bioresource Technology Reports 14, Nr. 100685. (DOI) (Weblink)

Zeitschriftenbeitrag (Meeting-Abstract)
  • Klammsteiner, T.; Yalçın, N.; Insam, H.; Hupfauf, S. (2021): Frass to gas: industrial insect rearing residues as co-substrates for anaerobic digestion.
    In: Bornimer Agrartechnische Berichte 105, S. 95. (Weblink)



Vorträge 2021

Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.

Posterpräsentation
  • Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Etemadi, Mohammad; Insam, Heribert; Podmirseg, Sabine Marie: CoMA, an intuitive and user-friendly pipeline for amplicon-sequencing data analysis.
    International Symposium on Anaerobic Microbiology 2021 online (ISAM2021 online), Innsbruck, 17.06.2021. (Weblink)

  • Vortragende/r: Klammsteiner, Thomas Co-AutorInnen: Yalçın, Nazlican; Insam, Heribert; Hupfauf, Sebastian: Frass to gas: industrial insect rearing residues as co-substrates for anaerobic digestion.
    INSECTA21 – International Conference, Magdeburg, online, 09.09.2021. (Weblink)



Publikationen 2020

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
  • Hupfauf, S; Etemadi, M; Fernández-Delgado Juárez, M; Gómez-Brandón, M; Insam, H; Podmirseg, S (2020): CoMA – an intuitive and user-friendly pipeline for amplicon-sequencing data analysis.
    In: PLoS One 15/12, No. e0243241. (Volltext) (DOI) (Weblink)

  • Hupfauf, S; Winkler, A; Wagner, A.O; Podmirseg, S.M; Insam, H (2020): Biomethanation at 45 °C offers high process efficiency and supports hygienisation.
    In: Bioresource Technology 300, No. 122671. (DOI) (Weblink)

Medienbeiträge

Beitrag in (Web-)Radiosendung
  • Kugler, G; Insam, H; Aigner, G; Hupfauf, S; Joshi, A; Vinzelj, J: Die Kleinen mit dem großen Einfluss.
    In: Radio Freirad - Verein Freies Radio Innsbruck vom 26.05.2020. (Weblink)



Publikationen 2019

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
  • Walter, Andreas; Probst, Maraike; Franke-Whittle, Ingrid H; Ebner, Christian; Podmirseg, Sabine Marie; Etemadi-Shalamzari, Mohammad; Hupfauf, Sebastian Johannes; Insam, Heribert (2019): Microbiota in anaerobic digestion of sewage sludge with and without co-substrates.
    In: Water and Environment Journal 33/2, S. 214 - 222. (Volltext) (DOI) (Weblink)



Vorträge 2019

Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.

Vortrag bei Projektmeeting / Forschungskooperationstreffen
  • Vortragende/r: Hupfauf, S Co-AutorInnen: Insam, H; Klammsteiner, T; Masebinu, S; Tonderski, K; Mbohwa, C; Etemadi, M; Podmirseg, S.M.: CoMA – An Intuitive Pipeline for Amplicon Sequencing Data Analysis.
    Biogas Research Meeting, Johannesburg, 03.05.2019. (Weblink)

  • Vortragende/r: Klammsteiner, Thomas Co-AutorInnen: Hupfauf, Sebastian; Insam, Heribert; Masebinu, S.; Tonderski, K.; Mbohwa, C.: Insect Biorefinery-Waste Management with Black Soldier Fly Larvae.
    Biogas Research Meeting, Johannesburg, 03.05.2019. (Weblink)



Publikationen 2018

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
  • Hupfauf, S.; Plattner, P.; Wagner, A. O.; Kaufmann, R.; Insam, H.; Podmirseg, Sabine Marie M. (2018): Temperature shapes the microbiota in anaerobic digestion and drives efficiency to a maximum at 45 °C.
    In: Bioresource Technology 269, S. 309 - 318. (DOI) (Weblink)



Vorträge 2018

Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.

Vortrag bei Projektmeeting / Forschungskooperationstreffen
  • Vortragende/r: Insam, H. Co-AutorInnen: Masebinu, S.; Hupfauf, S.; Klammsteiner, T.; Fajemilugba, O.; Olanrewanju, D.; Maile, O. L.; Walter, A.; Mbohwa, C.: Improving methane generation and quality of digestate by co-digestion with biochar at 45°C.
    South Africa-Austria Joint Researchers´ Closing Workshops, Pretoria, 11.12.2018.

Posterpräsentation
  • Vortragende/r: Nagler, Magdalena Co-AutorInnen: Jäger, A; Hupfauf, B; Insam, H; Podmirseg, Sabine Marie: Defining the best pre-treatment method for biomethanisation of sewage sludge and corn straw.
    6th International Conference on Sustainable Solid Waste Management, Naxos, 13.06.2018. (Weblink)



Vorträge 2017

Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.

Konferenzvortrag (Invited Plenary / Keynote Lecture)
  • Vortragende/r: Insam, Heribert Co-AutorInnen: Wett, Bernhard; Pümpel, Thomas; Nagler, Magdalena; Hupfauf, Sebastian; Tukanghan, Wisarut; Podmirseg, Sabine Marie: Anaerobes and climate.
    ISAM 2017 – The 10th International Symposium on Anaerobic Microbiology, Liblice, 14.06.2017. (Weblink)

Posterpräsentation
  • Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Plattner, P; Insam, H; Podmirseg, Sabine MarieM: Effect of temperature on the anaerobic digestion process.
    ISAM 2017 – The 10th International Symposium on Anaerobic Microbiology, Liblice, 13.06.2017. (Weblink)

Gastvorträge

Gastvortrag
  • Vortragende/r: Hupfauf, Sebastian Co-AutorInnen: Insam, Heribert; Plattner, Pia; Podmirseg, Sabine Marie; Mohammad, Etemadi: Improving Methane Generation and Agronomic Quality of Digestate through Co-digestion of Waste-Mixed Sludge and OFMSW: Assessing Digester Internal Process Conditions and Microbial Community.
    University of Johannesburg, Johannesburg, 13.12.2017.



Publikationen 2016

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Zeitschriftenaufsatz (Originalarbeit)
  • Hupfauf, S.; Bachmann, S.; Fernández-Delgado Juárez, M.; Insam, H.; Eichler-Löbermann, B. (2016): Biogas digestates affect crop P uptake and soil microbial community composition.
    In: Science of the Total Environment 542/Part B, S. 1144 - 1154. (DOI)



Publikationen 2015

Beiträge in Büchern / Zeitschriften

Beitrag in Proceedingsband (Abstract)
  • Nagler, M.; Jäger, A.; Hupfauf, B.; Insam, H.; Podmirseg, Sabine Marie (2015): Defining the best pre-treatment method for sewage sludge and corn straw.
    In: Fanedl, L., Avgustin, G.: 9th International Symposium on Anaerobic Microbiology (ISAM9). Domzale: Domzale Biotechnical Faculty., ISBN 978-961-6204-71-2, S. 61.



Vorträge 2015

Präsentationen auf Kongressen, Tagungen o.Ä.

Posterpräsentation
  • Vortragende/r: Nagler, M. Co-AutorInnen: Jäger, A.; Hupfauf, B.; Insam, H.; Podmirseg, Sabine Marie M.: Defining the best pre-treatment method for sewage sludge and corn straw biomethanisation.
    9th International Symposium on Anaerobic Microbiology (ISAM9), Portoroz, 26.06.2015. (Weblink)

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